Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hpf1Q8CFE2 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms