Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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