Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Snx16Q8C080 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms