Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Ccdc88cQ6VGS5 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Ccdc88cQ6VGS5 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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