Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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