Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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