Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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