Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rps29P62274 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rps29P62274 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rps29P62274 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms