Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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