Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms