Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms