Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Smg9Q9DB90 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Smg9Q9DB90 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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