Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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