Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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Sgo1Q9CXH7 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Sgo1Q9CXH7 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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Sgo1Q9CXH7 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Sgo1Q9CXH7 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sgo1Q9CXH7 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sgo1Q9CXH7 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sgo1Q9CXH7 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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