Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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