Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NischQ80TM9 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NischQ80TM9 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms