Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BC061212Q6P8K3 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms