Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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