Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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