Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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VdrP48281 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VdrP48281 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VdrP48281 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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