Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprkP35822 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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