Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcdP28867 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms