Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprmP28828 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms