Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
RxraP28700 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms