Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms