Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Tmf1B9EKI3 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Tmf1B9EKI3 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms