Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms