Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms