Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Bco1Q9JJS6 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Bco1Q9JJS6 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Bco1Q9JJS6 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Bco1Q9JJS6 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Bco1Q9JJS6 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Bco1Q9JJS6 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Bco1Q9JJS6 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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