Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc89Q9DA73 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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