Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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