Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ddb2Q99J79 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms