Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Apobec3Q99J72 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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