Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms