Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx16Q8C080 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms