Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Herc4Q6PAV2 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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