Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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