Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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