Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trafd1Q3UDK1 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms