Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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Q3U6N9 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Q3U6N9 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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