Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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