Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms