Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms