Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nedd1P33215 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms