Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Hoxc11P31313 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Hoxc11P31313 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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