Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PdgfraP26618 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PdgfraP26618 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PdgfraP26618 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PdgfraP26618 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PdgfraP26618 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PdgfraP26618 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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