Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms