Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms