Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17087V9GXQ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17087V9GXQ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms