Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac5Q9Z2V6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms